
ISA 계좌를 가지고 있다면, 연말정산 때 세액공제를 받을 수 있을지 궁금하시죠?
이번 글에서는 ISA 계좌와 연말정산의 관계, 세액공제 가능 여부, 신고 방법, 그리고 다른 절세 상품과의 비교까지 2025년 최신 정보를 기준으로 알기 쉽게 정리해드릴게요.
✅ ISA 계좌, 연말정산에 적용되나요?
❌ 결론부터 말하자면,
ISA 계좌는 직접적인 '세액공제' 대상이 아닙니다.
하지만!
ISA를 통해 발생한 수익에 대해 비과세 또는 분리과세 혜택을 받기 때문에, 연말정산에서 과세소득이 줄어드는 간접적인 절세 효과는 확실히 존재합니다.


✅ ISA 계좌와 세액공제의 차이
| 항목 | ISA | 연금저축 /IRP |
| 세액공제 여부 | ❌ 불가 | ✅ 가능 |
| 절세 방식 | 수익에 대한 비과세 (최대 400만 원) | 납입액에 대한 세액공제 (최대 700만 원) |
| 연말정산 필요 여부 | ❌ (자동 적용) | ✅ (소득공제 항목에 입력 필요) |
ISA는 연말정산에 ‘신고하지 않아도’ 계좌 내 수익에 대해 자동으로 비과세 혜택 적용됩니다.


✅ ISA 수익에 대한 과세 방식
ISA 계좌에 들어간 자산에서 발생한 수익은 아래 조건에 따라 과세 여부가 결정됩니다.
| 계좌 유형 | 비과세 한도 | 초과 수익 |
| 일반형 | 200만 원까지 비과세 | 초과분은 9.9% 분리과세 |
| 서민형·청년형 | 400만 원까지 비과세 | 초과분 9.9% 분리과세 |
예를 들어, 5년간 ISA에서 수익이 350만 원 발생했다면,
- 일반형은 200만 원까지 비과세, 150만 원은 9.9% 과세
- 청년형은 400만 원까지 비과세, 전액 비과세


✅ ISA 계좌 수익, 연말정산에 포함되나요?
연말정산 시 ISA 계좌 수익은 과세소득에서 제외되므로,
홈택스에 따로 입력하거나 신고하지 않아도 됩니다.
📌 단, 다음 2가지 경우는 꼭 기억하세요:
- ISA 의무보유 기간(3년)을 채우지 못하고 해지 시
👉 비과세 혜택 사라지고 전액 일반과세 적용 - ISA 수익이 비과세 한도를 초과했을 경우
👉 초과 수익에 대해 9.9% 분리과세가 적용되며,
이는 증권사가 자동으로 원천징수하므로 연말정산에 따로 반영할 필요는 없습니다.
✅ ISA vs IRP/연금저축: 연말정산에 어떤 게 유리할까?
| 항목 | ISA | IRP / 연금저축 |
| 세액공제 | ❌ 없음 | ✅ 있음 (연 700만 원 한도) |
| 수익 과세 | 비과세/분리과세 | 과세이연 → 연금 수령 시 분리과세 |
| 해지 시 세금 | 의무기간 미충족 시 전액 과세 | 중도 해지 시 세액공제 환수 |
| 활용 시점 | 단기~중기 절세 | 장기 은퇴 대비 중심 |
👉 연말정산에서 공제를 원한다면 IRP/연금저축이 필수, 하지만 ISA는 별도로 세금 없는 수익 창출이 가능한 계좌이므로 병행 활용이 가장 효과적입니다.
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✅ ISA 계좌 관련 연말정산 실수 방지 팁
- ✅ ISA 계좌는 연말정산에 입력하지 않아도 자동 처리
- ❌ IRP/연금저축과 혼동하여 ISA를 공제 항목으로 입력하지 않기
- ✅ ISA 계좌는 비과세 한도를 넘겼는지 확인
- ✅ 의무보유 기간(3년 이상) 반드시 체크
✅ ISA 계좌를 가지고 있는 사람의 연말정산 절세 팁
- ISA는 비과세로 수익 창출 → 과세 대상 소득 감소
- IRP, 연금저축 등 세액공제 상품과 병행 활용 시 절세 극대화
- 5년간 1억 원까지 납입 가능 → 장기 플랜 유리
- 청년형·서민형 활용 시 비과세 한도 더 큼


❓ 자주 묻는 질문 (FAQ)
Q1. ISA 계좌는 연말정산 홈택스에 따로 입력해야 하나요?
A. 아니요. ISA는 금융기관에서 자동으로 세금 처리하며, 홈택스에 따로 입력하지 않아도 됩니다.
Q2. ISA 계좌 수익도 종합소득세에 포함되나요?
A. 아니요. 비과세 한도 내 수익은 과세 대상에서 제외되며, 초과 수익은 분리과세(9.9%)로 원천징수됩니다.
Q3. ISA에서 손실이 났는데 연말정산에 반영되나요?
A. 반영되지 않습니다. 손실이 난 경우에는 별도 세제 혜택도 없고, 연말정산상 영향도 없습니다.
Q4. ISA는 소득공제와 무관한가요?
A. 네, ISA는 소득공제 항목이 아니며, 세액공제도 적용되지 않습니다.
Q5. ISA와 IRP를 같이 활용할 수 있나요?
A. 물론입니다. ISA로 비과세 수익을 만들고, IRP로 세액공제를 받으면 절세 효과를 극대화할 수 있습니다.
✍ 마무리 한마디
ISA 계좌는 직접적인 연말정산 소득공제 혜택은 없지만, 수익에 대한 비과세 혜택을 통해 간접적인 절세 효과를 만들어낼 수 있는 계좌입니다.
연금저축이나 IRP처럼 세액공제를 받는 상품과 함께 병행 활용한다면, 연말정산에서도, 투자에서도 훨씬 유리한 자산운용 전략이 될 수 있어요.
👉 다음 글에서는 “ISA와 연금저축/IRP 병행 전략으로 절세 극대화하는 법”을 알려드릴 예정이니, 구독과 북마크로 이어서 확인해보세요 😊
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